Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb1P09055 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms