Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxc8P09025 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms