Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Col4a2P08122 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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