Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CrygdP04342 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms