Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tgfb1P04202 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tgfb1P04202 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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