Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01747 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01747 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01747 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01747 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P01747 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01747 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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P01747 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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P01747 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01747 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01747 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01747 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01747 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01747 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01747 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01747 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01747 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01747 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01747 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01747 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01747 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01747 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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