Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vti1aO89116 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms