Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lmx1bO88609 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lmx1bO88609 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmx1bO88609 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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