Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfdp1O88271 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfdp1O88271 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms