Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a2O54833 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms