Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DffaO54786 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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DffaO54786 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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DffaO54786 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DffaO54786 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
DffaO54786 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms