Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Limk2O54785 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Limk2O54785 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms