Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sdc4O35988 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sdc4O35988 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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