Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FxnO35943 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FxnO35943 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FxnO35943 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FxnO35943 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FxnO35943 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FxnO35943 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FxnO35943 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FxnO35943 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FxnO35943 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FxnO35943 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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FxnO35943 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FxnO35943 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FxnO35943 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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