Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stag2O35638 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Stag2O35638 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms