Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcshO08795 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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