Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CckarO08786 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CckarO08786 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CckarO08786 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CckarO08786 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms