Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Barx2O08686 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Barx2O08686 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Barx2O08686 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Barx2O08686 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms