Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AlyrefO08583 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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