Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Efna5O08543 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms