Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm3278L7N2D2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3278L7N2D2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms