Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm2056J3QQ02 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm2056J3QQ02 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms