Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8888J3QPX5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms