Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Smim22J3QP37 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Smim22J3QP37 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Smim22J3QP37 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim22J3QP37 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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