Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm19965J3QNY8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Gm19965J3QNY8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm19965J3QNY8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms