Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Smim18J3QNP2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms