Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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Gm17577J3QNF7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Gm17577J3QNF7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Gm17577J3QNF7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Gm17577J3QNF7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Gm17577J3QNF7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Gm17577J3QNF7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Gm17577J3QNF7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Gm17577J3QNF7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm17577J3QNF7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm17577J3QNF7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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