Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm11236J3QMS7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm11236J3QMS7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm11236J3QMS7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm11236J3QMS7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm11236J3QMS7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm11236J3QMS7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm11236J3QMS7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm11236J3QMS7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm11236J3QMS7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm11236J3QMS7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm11236J3QMS7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm11236J3QMS7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
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