Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn34c3J3QJW5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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