Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf4bG5E8Z2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Taf4bG5E8Z2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms