Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20517G3UVU6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms