Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm28038F7BCN9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms