Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gm28048F7BCN0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm28048F7BCN0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Gm28048F7BCN0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm28048F7BCN0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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