Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tsc2-203ENSMUST00000226284 6266 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Epha5-201ENSMUST00000053733 7328 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Gm20538F6Z9R1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms