Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm17555F6U8B9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm17555F6U8B9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms