Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3M9

2010300C02Rik, RIKEN cDNA 2010300C02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010300C02RikE9Q3M9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2010300C02RikE9Q3M9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms