Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Fndc1E9Q043 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms