Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc144bE9PVZ3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms