Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30bE9PVL6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim30bE9PVL6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms