Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syde2E9PUP1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syde2E9PUP1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms