Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prrt2E9PUL5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms