Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Clca3bE9PUL3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms