Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms