Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rnf217D3YYI7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rnf217D3YYI7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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