Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm3259D3YUK0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms