Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cttnbp2B9EJA2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cttnbp2B9EJA2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms