Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm20547B8JJN0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Gm20547B8JJN0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm20547B8JJN0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm20547B8JJN0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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