Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11cB4XVP9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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