Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usf3B2RUQ2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Usf3B2RUQ2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Usf3B2RUQ2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms