Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Zbed5B2RPU8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Zbed5B2RPU8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Zbed5B2RPU8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbed5B2RPU8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Zbed5B2RPU8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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